Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM60Q9H2L4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM60Q9H2L4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms