Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms