Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM49AQ9H0Q0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM49AQ9H0Q0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms