Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms