Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12CQ9C0D7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms