Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms