Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms