Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms