Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms