Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms