Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms