Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM1Q9BY67 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CADM1Q9BY67 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms