Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms