Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms