Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms