Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms