Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms