Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms