Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM29Q9BSF4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms