Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms