Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms