Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms