Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms