Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms