Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms