Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms