Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms