Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ACCSQ96QU6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACCSQ96QU6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACCSQ96QU6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms