Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms