Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL3

ZNF599, Zinc finger protein 599, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF599Q96NL3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF599Q96NL3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF599Q96NL3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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