Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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