Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms