Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A4AQ96JQ5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms