Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms