Protein–RNA interactions for Protein: Q96II8

LRCH3, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH3Q96II8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH3Q96II8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH3Q96II8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH3Q96II8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH3Q96II8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH3Q96II8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH3Q96II8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH3Q96II8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH3Q96II8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH3Q96II8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms