Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUCLG2Q96I99 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SUCLG2Q96I99 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms