Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A3Q96HJ5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms