Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZC2HC1AQ96GY0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZC2HC1AQ96GY0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZC2HC1AQ96GY0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZC2HC1AQ96GY0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZC2HC1AQ96GY0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZC2HC1AQ96GY0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZC2HC1AQ96GY0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms