Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RNF185Q96GF1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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RNF185Q96GF1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RNF185Q96GF1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RNF185Q96GF1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF185Q96GF1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF185Q96GF1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF185Q96GF1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF185Q96GF1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF185Q96GF1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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