Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTV1Q96GA3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms