Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEIL1Q96FI4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms