Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms