Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms