Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4CQ96DT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms