Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMD3Q96D46 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMD3Q96D46 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms