Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms