Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms