Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP2A3Q93084 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms