Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PRG4Q92954 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRG4Q92954 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRG4Q92954 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PRG4Q92954 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRG4Q92954 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PRG4Q92954 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PRG4Q92954 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PRG4Q92954 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRG4Q92954 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRG4Q92954 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PRG4Q92954 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PRG4Q92954 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRG4Q92954 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms