Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms